Según algunas de las investigaciones, los recursos destinados para labores de inteligencia habrían pasado a manos de uniformados, anunciando en la cuenta de twitter Dejan de existir en el organigrama del comando de @FuerzasMilCol el Comando Conjunto de Inteligencia así como la Regional de Inteligencia: #LCVillegas.
En el momento las autoridades continúan investigando el presunto desvío de recursos de los gastos reservados, seguimientos ilegales y uso de información secreta en las Fuerzas Militares, de la misma manera Villegas acató la solicitud de la Procuraduría de suspender por 30 días los giros de recursos para la cuenta de gastos asignados a la Regional de Inteligencia Militar Estratégica Conjunta .